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RT-PCR實驗“兩步法”與“一步法”
RT-PCR 的實驗操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。
一步法 RT-PCR 能克隆微量 mRNA 而不需構建 cDNA 文庫(即 cDNA 合成與 PCR 反應在同一 Buffer 及酶中進行,一步法完成),省略了 cDNA 與 PCR 之間的過程。兩步法 RT-PCR 首先用反轉錄酶合成 cDNA,然后以 cDNA 為模板進行 PCR,即 RNA 反轉錄與 PCR 擴增分兩步進行。
一步法 RT-PCR 與兩步法相比快速、簡便、減少了污染機會、減少了 RNA 二級結構、減少了 PCR 反應的錯配率。RT-PCR 兩步法的優勢在于存在中間產物 cDNA,便于保存;且第二步 PCR 只取逆轉錄反應產物的 1/10 進行反應,有利于 PCR 條件的調整,實驗重現性強。
兩步法可以在第二步 PCR 反應體系中加入特異性引物,其靈敏度比一步法高。
兩步法的實驗預算要低于一步法。但是由于兩步法包括第一鏈 cDNA 合成和隨后的 PCR 反應,容易產生污染問題。
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